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Desde Dezembro de 2010 que têm aparecido surtos a grande escala de diarreia em leitões lactantes em toda a China e a vacinação contra a PEDV tem sido relativamente eficaz para a prevenção da diarreia. No entanto, em Fevereiro de 2017, produziram-se surtos de diarreia severa em explorações de porcos vacinados contra a PEDV em Guangdong, China. Todos os porcos doentes mostraram diarreia aquosa severa e o seu aparecimento clínico deu-se uns dias mais tarde que os infectados com PEDV. Em testes iniciais não foi detectada PEDV, vírus da gastroenterite transmissível, rotavírus suíno A ou deltacoronavirus suíno. Além disso, as porcas recuperadas não mostraram anticorpos seroneutralizantes contra PEDV.
Para investigar o possível agente patogénico causador, ou os agentes, foram obtidas excreções de 32 leitões recém-nascidos doentes de 3 explorações. Os leitões com 5 dias foram divididos em 4 grupos de 5 cada um (3 grupos segundo a origem das excreções, mais 1 grupo de controlo). Cada animal foi inoculado com 5 ml por via oral. Após 2 dias, todos os animais inoculados exibiram sintomas clínicos similares, incluindo diarreia e desidratação. Após juntar e mapear as leituras de sequenciação, foi obtida uma sequência completa do genoma da estirpe PEAV GDS04. O genoma completo da estirpe GDS04 PEAV comparte altas identidades de nucleótidos (≈95%) com as estirpes bat-HKU2 informadas. A análise filogenética baseada no genoma completo de GDS04 e representantes de 4 géneros de coronavirus estabelecidos, incluídos os coronavírus humanos e de morcego, demonstrou que GDS04 se agrupa com coronavirus tipo morcego. De acordo com a árvore filogenética, a posição de GDS04 está entre HKU2 e BtRf alfacoronavirus. A estirpe HKU2 foi identificada em Hong Kong e na província de Guangdong, China, em 2007, e a estirpe de alfacoronavirus BtRf foi detectada na China em 2012. Com base na análise comparativa e exaustiva dos genomas de vários grupos de coronavirus, classificou-se o GDS04 como um alfacoronavirus.
Foram desenhados primers específicos do gene n para a detecção da estirpe GDS04. Através do uso de PCR de transcripção inversa com estes primers, foi vrerificado que 97 das 308 amostras clínicas intestinais ou fecais foram positivas para GDS04. Foram recolhidas todas as amostras clínicas de 25 explorações na província de Guangdong durante Fevereiro - Abril de 2017 e utilizaram-se 20 amostras de leitões vacinados sãos como controlos negativos.
Este estudo apresenta dados preliminares sobre a detecção de um novo vírus de tipo coronavirus, PEAV. Cre-se que o PEAV é responsável pela diarreia endémica mais recente nas explorações suínas do sul da China. O isolamento do vírus e os testes serológicos estão a ocorrer. O surto do vírus recentemente descoberto surgiu entre porcos com diarreia severa em explorações de cria de porcos no Sul da China, o que sugere que os surtos regionais de diarreia poderão contribuir para o aparecimento de novos vírus pandémicos. É necessária uma ampla vigilância para GDS04 PEAV para definir a sua epidemiologia e evolução.
Gong L, Li J, Zhou Q, Xu Z, Chen L, Zhang Y, et al. A New Bat-HKU2–like Coronavirus in Swine, China, 2017. Emerg Infect Dis. 2017;23(9):1607-1609. https://dx.doi.org/10.3201/eid2309.170915
