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Estudos anteriores em animais produtores de alimentos relacionaram o uso de antimicrobianos (AMU) e resistência (AMR) em espécies bacterianas especificamente isoladas. Os dados de vários países são escassos e apenas descrevem diferenças entre os países.
Neste estudo foram investigadas as associações entre o resistoma móvel fecal suíno e as características a nível de exploração em toda a Europa. Foi realizado um estudo transversal entre 176 explorações de porcos convencionais de nove países europeus. Foram recolhidas vinte e cinco amostras fecais de porcos de engorda por exploração e os resistomas adquiridos foram determinados usando metagenómica de precisão e o banco de dados de referência Resfinder, ou seja, a colecção completa de genes AMR adquiridos horizontalmente (ARG).
Foram calculados os genes de resistência a fragmentos normalizados por kilobase de referência por milhão de fragmentos bacterianos (FPKM). Foram recolhidos dados específicos a nivel de exploração (AMU, biossegurança). Metanálises de efeitos aleatórios foram realizados por país, relacionando os dados a nível de exploração com as abundâncias relativas de ARG (FPKM).
AMU total durante a engorda foi relacionado positivamente com ARG total (FPKM total). Foram observadas associaçõoes positivas particularmente entre macrólidos e tetraciclinas amplamente utilizados e as ARG correspondentes às classes antimicrobianas respectivas. Não foram encontradas associações significativas de AMU-ARG para β-lactâmicos e foram encontrados poucos ARG de colistina, apesar do alto uso destas classes de antimicrobianos em porcos mais jovens. O aumento da biossegurança interna foi directamente relacionado com uma maior abundância de ARG que codificam principalmente a resistência aos macrólidos. Estes efeitos da biossegurança foram independentes de AMU em modelos mutuamente ajustados.
O uso de dados do resistoma em estudos de associação não tem precedentes e adiciona precisão e novos conhecimentos às associações AMU-AMR previamente observadas. Os componentes principais do resistoma suíno foram associadas de forma positiva e independente com AMU na exploração e as condições de biossegurança.
Van Gompel L, Luiken REC, Sarrazin S, et al. The antimicrobial resistome in relation to antimicrobial use and biosecurity in pig farming, a metagenome-wide association study in nine European countries. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2019; 74(4): 865–876. https://doi.org/10.1093/jac/dky518
