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O objectivo deste estudo foi a avaliação de métodos alternativos para a detecção e caracterização de Escherichia coli (E. coli) em casos reais de diarreias em leitões desmamados. Para isto foram analisadas amostras recolhidas através de zaragatoas com amostras de tecido intestinal dos mesmos leitões para comparar os isolados de E. coli, a concordância de ambos os antibiogramas e o genotipado de genes que codificam os pili e as toxinas.
Foi recolhida uma amostra de tecido, duas zaragatoas rectais e duas intestinais de 15 leitões procedentes de 4 explorações diferentes. Das culturas obtidas foi realizado um antibiograma (ceftiofur, gentamicina, neomicina e trimetoprim/sulfametoxazol) e PCR para identificar os genes de pili (F18 e K88) e os produtores de toxinas (STa, STb e LT). Os resultados foram avaliados para ver o grau de concordância a nível de animal e de exploração.
Foi isolada E. coli em ambos os métodos, mas o genotipado não concordou em 64 % dos casos a nível de animal. A nível de exploração, em 3 das 4 explorações, os genótipos de E. coli identificados mediante ambos os métodos não concordaram. Nestas explorações também houve diferenças quanto aos antibiogramas. Isto sugere que se necessitam amostras múltiplas para uma correcta caracterização da população de E. coli em condições de campo e que, tendo em conta ambos os resultados, é mais provável que obtenhamos um tratamento efectivo para toda a exploração.
A recolha de amostras de tecido recorre na necrópsia do animal permite a observação de lesões, pelo contrário a recolha de zaragatoas permite uma amostragem muito mais ampla da exploração, sem a necessidade de abater mais animais, ainda que não possa substituir completamente os diagnósticos adicionais realizados a partir das amostras de tecido. As zaragatoas podem ser usadas como um modo económico de ampliar a recolha de amostras para identificações complexas de E. coli.
J LeKander, AK Johnson. Comparison of Swabs and Tissue for Detection and Characterization of Escherichia coli in Clinical Post-weaning Diarrhea Cases. 2011. Iowa State University Animal Industry Report 2011
